プラグインから追加されたCSSデータは独立して保存されるので、テーマには依存しません。なのでご質問されたような心配はないです。
もし心配なら一応バックアップを取っておくと安心ですね。

参考になる記事をありがとうございます。

お忙しい中、申し訳ありませんが。 1点ご質問がありましてご連絡いたしました。

カスタムCSSのプラグインを使用中です。

今後、

bodyタグ内へ広告コードを追記するため、子テーマを作成
↓
親テーマのsingle.phpを子テーマにコピーする

といった作業を行おうとしております。

その場合、カスタムCSSで追記したデータは消えてしまうのでしょうか。

知識が乏しく、お力をお貸しいただけますと大変助かります。
お忙しい中、申し訳ありませんが、よろしくお願いいたします。